基本信息

姓名：丁若凡

职称：研究员

电子邮箱：dingruofan1@foxmail.com

教育经历

2017/09 - 2021/06, 厦门大学，生物化学与分子生物学，博士；

2014/09 - 2017/06, 西南交通大学，生物化学与分子生物学，硕士；

2010/09 - 2014/06, 西南交通大学，生物信息学，学士；

工作经历

2025/03 - 至今，获内蒙古大学“骏马计划”人才引进，任内蒙古大学生物医学研究院研究员；

2021/10 - 2025/02，深圳湾实验室系统与物理生物学研究所，博士后；

2021/07 - 2021/09，深圳华大基因研究院，生物信息助理研究员。

研究方向

聚焦于生物信息学与基因组学领域，通过研究遗传变异对基因表达等多种大分子调控的影响，进而解析复杂疾病的致病机制。核心方向包括：

1. 转录后调控与遗传变异关联分析。通过分析大规模转录组数据揭示生物大分子相关的遗传变异，探索其在多种疾病中的作用；

2. 单细胞水平的遗传调控解析。通过整合和构建单细胞遗传调控图谱，系统研究遗传变异在多种细胞类型中的特异性调控；

3. 多组学整合与疾病因果变异定位。通过共定位等方法揭示非编码区遗传变异通过调控基因表达等分子表型影响疾病的细胞特异性机制。

科研项目

1. 国家自然科学基金委员会，青年科学基金项目，2025.01 - 2027.12，主持；

2. 国家自然科学基金委员会，面上项目，2024.01 - 2027.12，主持。

代表性论文

代表性论文（#共同一作，*共同通讯）：

1．Ding, R. ^#, Wang, Q. #, Gong, L. . #, Zhang, T., Zou, X., Xiong, K., Liao, Q., Plass, M., & Li, L. (2024). scQTLbase: an integrated human single-cell eQTL database. Nucleic acids research, 52(D1), D1010–D1017.

2．Ding, R.^#, Zou, X.#, Qin, Y., Gong, L., Chen, H., Ma, X., Guang, S., Yu, C., Wang, G., & Li, L. (2024). xQTLbiolinks: a comprehensive and scalable tool for integrative analysis of molecular QTLs. Briefings in bioinformatics, 25(1), bbad440.

3．Ding, R.^#, Zhang, Y. ^#, Wu, L. Y., You, P., Fang, Z. X., Li, Z. Y., Zhang, Z. Y., & Ji, Z. L. (2022). Discovering Innate Driver Variants for Risk Assessment of Early Colorectal Cancer Metastasis. Frontiers in oncology, 12, 898117.

4．Ding, R.^#, Yu, Q., Liu, K., Du, J., Yin, H. J., & Ji, Z. L. (2021). Gene network analyses unveil possible molecular basis underlying drug-induced glaucoma. BMC medical genomics, 14(1), 109.

5．Yue, Q. ^#, Ding, R. ^#, Chen, W., Wu, L., Liu, K., & Ji, Z. (2024). Mining Real-World Big Data to Characterize Adverse Drug Reaction Quantitatively: Mixed Methods Study. Journal of medical Internet research, 26, e48572.

6．Zou, X. ^#, Ding, R. ^#, Chen, W., Wang, G., Cheng, S., Wang, Q., Li, W., & Li, L. (2022). Using population-scale transcriptomic and genomic data to map 3' UTR alternative polyadenylation quantitative trait loci. STAR protocols, 3(3), 101566.

7．Liu, K. ^#, Ding, R. ^#, Xu, H., Qin, Y. , He, Q., Du, F., Zhang, Y., Yao, L., You, P., Xiang, Y. P., & Ji, Z. (2020). Broad-Spectrum Profiling of Drug Safety via Learning Complex Network. Clinical pharmacology and therapeutics, 107(6), 1373–1382.

发明专利

一种风险量化评估模型建立方法 (2023年12月).公开号: CN113627763B.

招生意向

课题组（细胞命运与疾病解码实验室）欢迎热爱或者毕业于生物信息学、统计学、软件工程、计算机科学、医学和生物学等学科方向的同学报考硕博研究生或入组联培，诚邀优秀的博士英才合作进行博士后研究，同时也提供少量本科生科技创新及毕业设计名额。